Efficient Microarray Data Analysis Using R and FSPMA (in Eng.) ist ein kleines (1,5 ECTS) freies Wahlfach von Peter Sykacek. Man lernt hier mit einem R-package (FSPMA) die Analyse von Mircoarray-data sets.

Mir hat die LVA eigentlich gut gefallen, weil man das R Wissen aus anderen Lecutres (e.g Statistic with R) und das statistische Wissen (e.g. Multivariate Statistics) gut nutzen und verknüpfen konnte. Am ersten Tag gab es am Vormittag eine theoretische lecture und dann ging es die restlichen Tage nur noch ans coden und analysieren von dem Daten Set (es waren Microarray Daten von Cancer vs. non-cancer tissue) und es ging darum einige Kandidaten zu finden in dem großen Datenset.

Es gab Studierende die ohne Vorkenntnisse drinnen waren, denen kann man aber dann gemeinsam mit Peter Sykacek sehr gut helfen, da er sehr bemüht ist, dass alle was mitnehmen. Nach meinem Gefühl ist das "learning outcome" jedoch besser, wenn die LVA erst nach einigen grundlegenden Bioinformatik Schwerpunkt LVAs besucht wird.

Gelohnt hat es sich auf jeden Fall und R macht ja immer Spaß

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" Nur durch beständige Ausführung des scheinbar Unmöglichen kann der Erfolg gesichert werden."  (Peter Kropotkin)