Hallo,

kann sich jemand so ungefähr daran erinnern, was die Kasper so prüft?
Anscheinend kommen bei Ihr Theorie und bei Jungbauer großteils Rechnungen, ist das richtig?

Bin für jeden Tip dankbar!

GLG

Nachdem der ganze Beitrag gerade gelöscht wurde hier nochmal die Fragen von heute in Kurzfassung:

Kasper 20,5 Punkte
Jungbauer 18 Punkt (je Rechenbeispiel 9 Pkt)

KASPER

Worauf muss man bei einem Upstream process achten? (3 P)
- ich glaube das spielt auf die 3 Punkte cell culture design, media design und Reaktor design an?

-Vaccine production welche Punkt bei upstream wichtig? (6 P)
-Welche 2 Schritte gibt es bei vaccine production und welche Zellen werden verwendet dafür? (3P) die beiden Fragen haben sich irgendwie fast überschnitten, keine Ahnung...

-Welche Möglichkeiten gibt es einen Prozess zu betrieben? (1P)

-Nennen Sie Single use devices (3P)

-Vorteile von Disposibles nennen (3P)

nicht vollständig!

JUNGBAUER

Ein Beispiel mit E.coli Kultur und man soll Viskosität berechnen. Gegeben war die dry mass mit 15 g/L und Scherrate mit 10 s^-1. Frage wie die Viskosität ist und wie sie nach dem Homogenisierungsschritt ist. Letzte Unterfrage war was die Scherrate eigentlich aussagt (bzw ob sie aussagekräftig ist).

Ein Beispiel mit Protein mit 20000 g/mol präcipitiert, am Anfang c=20 mg/ml nach 1 Minute nur noch 0,2 mg/ml. Berechnen sollte man die Größe des Proteins (über Diffusionskoeffizienten und rh) und schätzen, wie viele Proteine sich zusammenlagern.


Es ist irgendwie weiterhin unklar welche Unterlagen man verwenden darf, viele waren mit Doran und Folien von Jungbauer da aber so richtig offen hat sie auch niemand gehabt. Prüfungsaufsicht ist auf jeden Fall sehr tolerant

Process of vaccine production: 2 phases…
Disadvantage of vaccine production in eggs
Advantage of vaccine production in cell culture over production in eggs
Which chemical parameter indicates cell death during virus production phase
Differences between extractables and leachables
3 examples of possible signs of leaching in single use cultivation and 3 factors influencing the strength of the effect oder so
What are the advantages of using disposable upstream process equipment
Disadvantages of disposable
Tabelle mit MDCK cells vs Vero cells

You must process E.coli cells, therefore the viscosity is relevant.
1) Calculate the viscosity of an E.coli broth with a dry cell weight of 25 gL-1 at a shear rate of 10 and 20 s-1
2) How much increases the viscosity when the cells are homogenized. Describe and justify your assumptions, which you have made.
You will precipitate an antibody from culture supernatant with 2M ammonium sulfate. The solubility oft he antibody in the culture supernatant is 100 mg*mL-1. Your salting out constant is 0,05.
1) Calculate the residual antibody concentration in your supernatant and the yield of your purification by this precipitation.
2)Repeat the calculation without neglecting the salt concentration in the supernatant. Justify your assumptions.

Da ja am Donnerstag die nächste Prfg ist:
Hat wer das Aggregationsbsp gerechnet? - Komm auf kan grünen Zweig..

*) C0=20mg/mL mit 20000 Da sinds 10^(-6) mol/mL
Ct=0,2mg/mL mit 20000 Da sinds 10^(-8) mol/mL
t=60sec
D im Medium is 1/10 von dem in Wasser.

*) Damit über perikinetische Formel kappa=1,65E+6 mL/(mol*s)
Perikinetische weils offenbar einfach reingeleert wird und kein Reaktor oder hochkomplexer Schas gefragt is...

*) Diffusionskoeffizient aus Tyn/Gusek
D(in Wasser)=9,95E-7 cm2/s und damit Ds=9,95E-8 cm2/s im Medium.

*) kappa = 8pi*D*Nav*dp den Partikeldurchmesser...
dp=1,1E-12 cm (das kann schon mal nicht sein, ich find aber keinen Fehler)

*) rh über Stokes-Einstein für Wasser (µ=0,001, und den D(in Wasser) bei 293K)
rh=2,16 nm (klingt realistisch)

*) Abschätzung mit Fraktal Df=2,4 zb und in (r/rh)^Df einsetzen - das geht natürlich nicht wenn der Partikelradius unfassbar kleiner ist als der Proteinradius...

Vlt gibts ja noch wen der sich damit herumplagt und schon gscheiter is als ich. Ist vlt doch orthokinetisch mit diversen Annahmen die Methode der Wahl?

Up- & Downstream Prüfungsfragen vom 23.02.2016:
Kasper-Teil
1. List basic elements for a drug manufacturing process
2. Explain: CIP,CDS,WFI
3. List pitfalls/problems in medium preparation, name osmoregulators and ions which can cause problems
4. Give examples for essential media components and undesired components and supplements
5. Which parameters influence product quality during cultivation of animal cells
6. PER.C6
a) how is the cell line generated? Where is it applied?
b) give examples for 2 processes in 2 different modes
7. Vaccine production – 2 phases + cell lines used for influence production
8. Disadvantages of production in eggs
9. Advantages of production in cell culture
10. A) reasons for disposables
b) difference between extractables and leachables
c) signs for leachables + factors influencing the strength
11. Biometric methods-Greek latin squares (calculate how many tests are needed with and without, when you have to optimize 4 different components and you have 3 options for each of them)
12. Oxygen tension, pO2


13. Scheme of generating BEVS
14. Table: mammalian vs. insect cells
15. Table: Sf9 vs. High5
16. Table: 4 processes: 2 with MDCK and 2 with Vero cells, TCID50 (viron/mL), log 10 HA units/uL, titer peak time (p.i) are given- choose the best process and explain

Jungbauer Teil

17. Ammonium sulfate precipitation
0.5 M (NH4)2SO4 – solubility of the protein: 100 mg/mL
1 M (NH4)2SO4 – 10 mg/mL
1.5 M – 1 mg/mL

Gesucht: solubility curve
c(start)= 40 mg/mL, Y= 90% -> how much (NH4)2SO4 is needed?
Is Y= 99,9% reasonable?
Use sodium citrate instead (assume same surface tension) how much sodium citrate is needed?
How does the surface tension qualitatively influence the required concentration?
18. Purification
2 mg/mL endotoxin as EC-5 standard
intravenously applied, dose = 200 mg
Gesucht: clearance
number of purification steps +average clearance
Y(final), Y per step = 90%
which unit operation is needed for this process?

Up + Downstream Prüfung von 18.3.16
Kaspar Teil (Das selbe wie am 23.02.16)
1. List basic elements for a drug manufacturing process
2. Explain: CIP,CDS,WFI
3. List pitfalls/problems in medium preparation, name osmoregulators and ions which can cause problems
4. Give examples for essential media components and undesired components and supplements
5. Which parameters influence product quality during cultivation of animal cells
6. PER.C6
a) how is the cell line generated? Where is it applied?
b) give examples for 2 processes in 2 different modes
7. Vaccine production – 2 phases + cell lines used for influence production
8. Disadvantages of production in eggs
9. Advantages of production in cell culture
10. A) reasons for disposables
b) difference between extractables and leachables
c) signs for leachables + factors influencing the strength
11. Biometric methods-Greek latin squares (calculate how many tests are needed with and without, when you have to optimize 4 different components and you have 3 options for each of them)
12. Oxygen tension, pO2
13. Scheme of generating BEVS
14. Table: mammalian vs. insect cells
15. Table: Sf9 vs. High5
16. Table: 4 processes: 2 with MDCK and 2 with Vero cells, TCID50 (viron/mL), log 10 HA units/uL, titer peak time (p.i) are given- choose the best process and explain

Jungbauer Teil

17.)PEG Fraktionierung:
Gegeben zwei Geraden mit den Werten der Löslichkeit des Proteins und der Verunreinigung bei bestimmten % an PEG. (Graphik Y Achse löslichkeit von Protein und Verunreinigung vs X Achse % PEG) --> Die Werte der Geraden waren auch als Graphik gegeben.
Gegeben waren weiters die Konzentration des Proteins vor der fällung(10mg/mL) und der gewollte Yield(90%).
a) berechne die benötigte PEG Konzentration um auf den Yield zu kommen.
b) berechne die Reinheit, wenn die Konzentration der Verunreinigung gleich der Konzentration des Proteins ist.
c)Ist die Methode sinnvoll, wenn die Proteinkonzentration 1mg/ml und die Verunreinigungskonz 10mg/mL ist?

18.)Virusinaktivierung
Ich zitiere wort Wörtlich:
For Virus Inactivation you have to develop a sampling plan. You want to avoid false negative results with probability of 0,001. Your Virus titer after inactivation is -2
a)calculate the sampling volumen to meet the probability
b)discuss why this inactivation step cannot be validated and another strategie must be developed

Liebe Grüße Mr Burns^^

Kasper:
- CIP, CDS, WFI explain
- essential media components, choose one kind of supplement and explain (adv./disadv.)
- PerC6: generation, 2 processes in 2 modes
- vaccine production: 2 phases
- list disposables: advantages/disadvantages
- difference leachables and extractables. possible signs of leaching and influencing factors
- Biosimilars, biobetters
- Feeding strategies
- Analytical methods and examples
- Biological production systems

Jungbauer:
5 µm floc (=particle), Mr (protein):250000 Da, How many proteins have aggregated into the particle?

You do a flocculation with PEG in a cstr. Shear rate war gegeben. Use the Camp-number! Upscale: You want to process 5 m³ and switch into a tubular flow reactor. Calculate the dimensions of the reactor!

Prüfung 13.04.2018

Kasper:
Vor allem Altfragen, ein paar neue Sachen waren dabei:
zB:
two possibilites to isolate primary cells
definition of biosimilar, biobetter and bioidentical
advantages of personalized medicine (at least 3)
1000 L single use reactor, pump into liquid through an opening of 19 mm, how long does it take?

Jungbauer (kann mich nicht mehr auf den genauen Wortlaut erinnern):
1)
safety factor of a diploid cell is assumed; if one makes the same cell but haploid, does one need to remove less DNA?
2)
3 concentrations of Ammoniasulfate and its corresponding solubilty concentrations
One had to plot the log solubility against NH4SO4 molarity and against the ionic strength,
determine the salting out constant and calculate the needed NH4SO4 concentration for a yield of 90% (starting conc = 15 mg/mL protein)
3)
IEF
isomers of two different proteins of different MW (15 kDa and 200 kDa) are separated by IEF separetely; how much does the resolution differ between the two proteins